本廠為了確保操作營運品質提升至國際水準，於民國86年12月開始積極導入ISO14001環境管理系統，並於87年4月通過已有二百四十多年之歷史，為世界上最大、最著名，且歷史最悠久之船級協會『英國勞氏驗船協會(LRQA)』 國際標準組織ISO 認證，成為全國第一座取得ISO14001環境管理系統認證的焚化廠。

　　 民國87年6月開始推行ISO9002品質管理系統認證，並與原有之ISO14001環境管理系統整合後，制定更嚴格的品質管理及環境管理標準，建立了「全面品質」的管理體系，於88年2月通過認證，成為第一座取得雙認證之焚化廠。